MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 8717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021823	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021823	AGC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021823	A	6	6	34	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021823	A	6	6	70	75	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021823	ATG	2	6	86	91	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021823	CAG	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021823	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021823	TAC	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021823	A	6	6	285	290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021823	TCAT	2	8	291	298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021823	AAT	2	6	311	316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021823	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021823	ATA	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021823	AAT	2	6	557	562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021823	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021823	TTC	2	6	644	649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021823	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021823	GAA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021823	AT	3	6	745	750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021823	AG	3	6	4956	4961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021823	AGG	2	6	4977	4982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021823	GGA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021823	CTTT	2	8	5848	5855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021823	AGATTT	2	12	5862	5873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021823	T	6	6	5871	5876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021823	TCC	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021823	A	6	6	8616	8621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021823	ATG	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021823	AGA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021823	AGG	2	6	8727	8732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021823	T	7	7	10098	10104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021823	GTT	2	6	10109	10114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021823	T	6	6	10125	10130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021823	A	6	6	10150	10155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021823	A	7	7	12583	12589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021823	AATTA	2	10	12600	12609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021823	TGT	2	6	13673	13678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021823	TCCT	2	8	13695	13702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021823	TAT	2	6	13703	13708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021823	AAT	2	6	13716	13721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021823	T	7	7	13721	13727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021823	TAA	2	6	13765	13770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021823	ATGT	2	8	13777	13784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021823	CTA	2	6	13821	13826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021823	TGA	2	6	13876	13881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021823	A	6	6	15078	15083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021823	T	7	7	15108	15114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021823	TCC	2	6	16045	16050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021823	GGA	2	6	16104	16109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021823	A	6	6	16132	16137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021823	TCC	2	6	16505	16510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021823	CCT	2	6	17511	17516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021823	TCC	2	6	18457	18462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021823	CCA	2	6	18490	18495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021823	TCC	2	6	19762	19767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021823	AAAAC	2	10	19789	19798	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021823	TAA	2	6	19821	19826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021823	T	6	6	19899	19904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021823	T	7	7	19923	19929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021823	A	7	7	19944	19950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021823	GA	3	6	19967	19972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021823	ATT	2	6	20004	20009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021823	CAT	2	6	20978	20983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021823	TATT	2	8	21122	21129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021823	A	7	7	21136	21142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021823	CAAA	2	8	21143	21150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021823	T	7	7	21151	21157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021823	T	6	6	21183	21188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021823	ATT	2	6	21192	21197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021823	AGA	2	6	21200	21205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021823	ATT	3	9	21209	21217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021823	TA	3	6	21282	21287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021823	ATT	2	6	21299	21304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021823	A	7	7	24371	24377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021823	TGT	2	6	25275	25280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021823	AGG	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021823	A	6	6	26360	26365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021823	TTC	2	6	27046	27051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021823	TTC	3	9	27058	27066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021823	A	6	6	27134	27139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021823	TA	3	6	27154	27159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021823	A	7	7	27194	27200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021823	TAT	2	6	27204	27209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021823	CTATG	2	10	27213	27222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021823	AGAA	2	8	27236	27243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021823	AGA	2	6	28467	28472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021823	CTTA	2	8	28479	28486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021823	GGA	2	6	30032	30037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021823	T	7	7	30042	30048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021823	CTA	2	6	30090	30095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021823	T	6	6	31568	31573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021823	TCC	2	6	32624	32629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021823	TA	4	8	32630	32637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021823	AAAGA	2	10	32667	32676	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021823	ATT	2	6	32692	32697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021823	TAT	2	6	32715	32720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021823	TAA	2	6	32757	32762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021823	AAAT	2	8	32840	32847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021823	CT	3	6	32976	32981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021823	T	7	7	32981	32987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021823	A	6	6	33924	33929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021823	CTT	2	6	33933	33938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021823	AGAA	2	8	33945	33952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021823	AGA	2	6	35421	35426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021823	TG	3	6	35439	35444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021823	TGT	2	6	35473	35478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021823	TTG	2	6	35490	35495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021823	T	6	6	35533	35538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021823	AGA	2	6	35587	35592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021823	A	7	7	35599	35605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021823	ATA	2	6	35649	35654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021823	ATT	2	6	35695	35700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021823	ATT	2	6	35709	35714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021823	TA	3	6	35757	35762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021823	A	6	6	35762	35767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021823	TTA	2	6	42246	42251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021823	AAT	2	6	42281	42286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021823	ATA	2	6	43497	43502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021823	GAT	2	6	43542	43547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021823	A	6	6	44589	44594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021823	A	7	7	45923	45929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021823	TGT	2	6	45943	45948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021823	A	6	6	45974	45979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021823	AAT	2	6	45983	45988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021823	A	7	7	46002	46008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021823	AACG	2	8	46065	46072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021823	TAT	2	6	46100	46105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021823	AAATAA	2	12	46143	46154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021823	A	6	6	46153	46158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021823	TAAA	2	8	46167	46174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021823	TAAA	2	8	46189	46196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021823	TAA	2	6	46204	46209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021823	ATA	2	6	46216	46221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021823	ATAAA	2	10	47637	47646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021823	TAT	2	6	47649	47654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021823	AAG	2	6	48410	48415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021823	CTT	2	6	48446	48451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021823	T	6	6	48450	48455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021823	AT	3	6	48516	48521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021823	ATA	2	6	48533	48538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021823	TA	3	6	48551	48556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021823	GAAA	2	8	48622	48629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021823	ATT	2	6	48651	48656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021823	T	6	6	48719	48724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021823	AT	3	6	48730	48735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021823	ATT	2	6	48737	48742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021823	TAGTA	2	10	48759	48768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021823	GAG	2	6	48817	48822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021823	ATT	2	6	50306	50311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021823	ATA	2	6	50314	50319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021823	A	6	6	50319	50324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_021823	AGA	2	6	97232	97237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_021823	CGA	2	6	97246	97251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_021823	ATG	2	6	97272	97277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021823	A	6	6	97450	97455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021823	TAAAA	2	10	97945	97954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021823	TCC	2	6	97957	97962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_021823	ATC	2	6	98666	98671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_021823	A	7	7	98695	98701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021823	A	6	6	98728	98733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021823	TCC	2	6	100435	100440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_021823	T	6	6	158653	158658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_021823	T	6	6	173082	173087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_021823	AG	4	8	176207	176214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_021823	AG	3	6	177620	177625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
493	NC_021823	AGG	2	6	177639	177644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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